MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 chromosome

Total Repeats: 73407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019393	TTTG	2	8	636	643	0 %	75 %	25 %	0 %	410859654
2	NC_019393	T	6	6	646	651	0 %	100 %	0 %	0 %	410859654
3	NC_019393	AAC	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859654
4	NC_019393	TTGT	2	8	775	782	0 %	75 %	25 %	0 %	410859655
5	NC_019393	GAA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859655
6	NC_019393	GTT	2	6	798	803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410859655
7	NC_019393	TAA	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410859655
8	NC_019393	ACT	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410859655
9	NC_019393	AG	3	6	879	884	50 %	0 %	50 %	0 %	410859655
10	NC_019393	CTC	2	6	901	906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410859655
11	NC_019393	GTG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859655
12	NC_019393	CAA	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859655
13	NC_019393	TTC	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859655
14	NC_019393	GCA	2	6	1091	1096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859655
15	NC_019393	CTT	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859655
16	NC_019393	CAATG	2	10	1172	1181	40 %	20 %	20 %	20 %	410859655
17	NC_019393	AAT	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410859655
18	NC_019393	AGC	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859655
19	NC_019393	GGCA	2	8	1233	1240	25 %	0 %	50 %	25 %	410859655
20	NC_019393	AAC	2	6	1263	1268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859655
21	NC_019393	CAC	2	6	1300	1305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410859655
22	NC_019393	GATCCC	2	12	1313	1324	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410859655
23	NC_019393	GCA	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859655
24	NC_019393	CAA	2	6	1430	1435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859655
25	NC_019393	GGC	2	6	1440	1445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410859655
26	NC_019393	TTTA	2	8	1461	1468	25 %	75 %	0 %	0 %	410859655
27	NC_019393	GGT	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859655
28	NC_019393	ACTT	2	8	1495	1502	25 %	50 %	0 %	25 %	410859655
29	NC_019393	GGTA	2	8	1508	1515	25 %	25 %	50 %	0 %	410859655
30	NC_019393	TAA	2	6	1529	1534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410859655
31	NC_019393	TA	3	6	1552	1557	50 %	50 %	0 %	0 %	410859655
32	NC_019393	GAT	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859655
33	NC_019393	TTC	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859655
34	NC_019393	AAG	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859655
35	NC_019393	ATT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859655
36	NC_019393	GATA	2	8	1761	1768	50 %	25 %	25 %	0 %	410859655
37	NC_019393	AGA	2	6	1790	1795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859655
38	NC_019393	TTGG	2	8	1813	1820	0 %	50 %	50 %	0 %	410859655
39	NC_019393	TTC	2	6	1923	1928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859655
40	NC_019393	TGCTAA	2	12	1988	1999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410859655
41	NC_019393	ATA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410859655
42	NC_019393	ATT	2	6	2110	2115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859655
43	NC_019393	ACG	2	6	2147	2152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859655
44	NC_019393	CA	3	6	2256	2261	50 %	0 %	0 %	50 %	410859655
45	NC_019393	AGC	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859655
46	NC_019393	AGA	2	6	2300	2305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859655
47	NC_019393	AAC	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859655
48	NC_019393	AC	3	6	2464	2469	50 %	0 %	0 %	50 %	410859656
49	NC_019393	AAG	2	6	2609	2614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859656
50	NC_019393	ATT	2	6	2624	2629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859656
51	NC_019393	TC	3	6	2661	2666	0 %	50 %	0 %	50 %	410859656
52	NC_019393	CAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859656
53	NC_019393	TAT	2	6	2849	2854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859656
54	NC_019393	AGA	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859656
55	NC_019393	ATT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859656
56	NC_019393	ATC	2	6	3054	3059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410859656
57	NC_019393	T	6	6	3066	3071	0 %	100 %	0 %	0 %	410859656
58	NC_019393	TAG	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859656
59	NC_019393	TCG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859656
60	NC_019393	GCT	2	6	3200	3205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859656
61	NC_019393	TCT	2	6	3248	3253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859656
62	NC_019393	GAA	2	6	3290	3295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859656
63	NC_019393	GAA	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859656
64	NC_019393	TGA	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859656
65	NC_019393	AAGT	2	8	3402	3409	50 %	25 %	25 %	0 %	410859656
66	NC_019393	GAT	2	6	3452	3457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859656
67	NC_019393	CTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859657
68	NC_019393	CGT	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859657
69	NC_019393	TTG	2	6	3687	3692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410859657
70	NC_019393	TAT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859657
71	NC_019393	ATTC	2	8	3879	3886	25 %	50 %	0 %	25 %	410859657
72	NC_019393	GCA	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859657
73	NC_019393	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859657
74	NC_019393	ACA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859657
75	NC_019393	GAA	2	6	4145	4150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859657
76	NC_019393	AGTT	2	8	4189	4196	25 %	50 %	25 %	0 %	410859657
77	NC_019393	ATT	2	6	4216	4221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859657
78	NC_019393	GAA	2	6	4235	4240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859657
79	NC_019393	TTC	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859657
80	NC_019393	A	6	6	4319	4324	100 %	0 %	0 %	0 %	410859657
81	NC_019393	ATG	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859657
82	NC_019393	TGA	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859657
83	NC_019393	GAAAA	2	10	4646	4655	80 %	0 %	20 %	0 %	410859657
84	NC_019393	CAG	2	6	4706	4711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859658
85	NC_019393	AAC	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859658
86	NC_019393	GTAT	2	8	4778	4785	25 %	50 %	25 %	0 %	410859658
87	NC_019393	TGA	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859658
88	NC_019393	GGT	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859658
89	NC_019393	TTG	2	6	4883	4888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410859658
90	NC_019393	TGA	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859658
91	NC_019393	GGT	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859658
92	NC_019393	AGT	2	6	5070	5075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859658
93	NC_019393	GTG	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859658
94	NC_019393	AGA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859658
95	NC_019393	GGT	2	6	5362	5367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859658
96	NC_019393	CTG	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859658
97	NC_019393	CCA	2	6	5412	5417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410859658
98	NC_019393	AAC	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859658
99	NC_019393	CGG	2	6	5538	5543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410859658
100	NC_019393	GTG	2	6	5564	5569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859658
101	NC_019393	AAGG	2	8	5602	5609	50 %	0 %	50 %	0 %	410859658
102	NC_019393	A	6	6	5617	5622	100 %	0 %	0 %	0 %	410859658
103	NC_019393	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859658
104	NC_019393	TCT	2	6	5731	5736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859658
105	NC_019393	CTG	2	6	5747	5752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859658
106	NC_019393	TGC	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859658
107	NC_019393	CG	4	8	5845	5852	0 %	0 %	50 %	50 %	410859658
108	NC_019393	CGT	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859658
109	NC_019393	GCGG	2	8	5989	5996	0 %	0 %	75 %	25 %	410859658
110	NC_019393	TCGTAA	2	12	6012	6023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410859658
111	NC_019393	AAG	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859658
112	NC_019393	CAT	3	9	6183	6191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410859658
113	NC_019393	TTC	2	6	6244	6249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859658
114	NC_019393	ATT	2	6	6268	6273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859658
115	NC_019393	GAA	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859658
116	NC_019393	GAC	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859658
117	NC_019393	TGA	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859658
118	NC_019393	GTG	2	6	6434	6439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859658
119	NC_019393	TCAG	2	8	6468	6475	25 %	25 %	25 %	25 %	410859658
120	NC_019393	AGA	2	6	6558	6563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859658
121	NC_019393	ATG	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859658
122	NC_019393	GCTGA	2	10	6670	6679	20 %	20 %	40 %	20 %	410859658
123	NC_019393	TAC	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410859658
124	NC_019393	ATC	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410859658
125	NC_019393	TAT	2	6	6732	6737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859658
126	NC_019393	GTC	2	6	6756	6761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859658
127	NC_019393	ATG	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859658
128	NC_019393	GTG	2	6	6833	6838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859658
129	NC_019393	AATG	2	8	6885	6892	50 %	25 %	25 %	0 %	410859658
130	NC_019393	AGC	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859658
131	NC_019393	ACG	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410859658
132	NC_019393	CGC	2	6	6985	6990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410859658
133	NC_019393	AG	3	6	7072	7077	50 %	0 %	50 %	0 %	410859658
134	NC_019393	GTA	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859659
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141	NC_019393	GGC	2	6	8074	8079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410859660
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253	NC_019393	ATG	2	6	15845	15850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859668
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257	NC_019393	GTT	2	6	16160	16165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410859668
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261	NC_019393	AGA	2	6	16399	16404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859668
262	NC_019393	TG	3	6	16441	16446	0 %	50 %	50 %	0 %	410859668
263	NC_019393	GAT	2	6	16461	16466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410859668
264	NC_019393	ATC	2	6	16469	16474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410859668
265	NC_019393	GC	3	6	16593	16598	0 %	0 %	50 %	50 %	410859668
266	NC_019393	TAT	2	6	16615	16620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410859668
267	NC_019393	GCT	2	6	16656	16661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859668
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269	NC_019393	CTT	2	6	16692	16697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859668
270	NC_019393	CTT	2	6	16704	16709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859668
271	NC_019393	GGC	2	6	16729	16734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410859668
272	NC_019393	CTT	2	6	16782	16787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859668
273	NC_019393	GCAA	2	8	16807	16814	50 %	0 %	25 %	25 %	410859668
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275	NC_019393	ATATT	2	10	16875	16884	40 %	60 %	0 %	0 %	410859668
276	NC_019393	AAGCG	2	10	16889	16898	40 %	0 %	40 %	20 %	410859668
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281	NC_019393	TTC	2	6	17401	17406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859668
282	NC_019393	GCT	2	6	17479	17484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859668
283	NC_019393	CGC	2	6	17520	17525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410859668
284	NC_019393	CACT	2	8	17538	17545	25 %	25 %	0 %	50 %	410859668
285	NC_019393	GTT	2	6	17592	17597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410859668
286	NC_019393	TTC	2	6	17692	17697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859668
287	NC_019393	TA	4	8	17769	17776	50 %	50 %	0 %	0 %	410859668
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293	NC_019393	CTT	2	6	18146	18151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410859668
294	NC_019393	GGCG	2	8	18167	18174	0 %	0 %	75 %	25 %	410859668
295	NC_019393	TCG	2	6	18200	18205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410859668
296	NC_019393	GGT	2	6	18335	18340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410859668
297	NC_019393	CAA	2	6	18378	18383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410859668
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300	NC_019393	A	6	6	18839	18844	100 %	0 %	0 %	0 %	410859669
301	NC_019393	AAG	2	6	18927	18932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410859669
302	NC_019393	GC	3	6	19040	19045	0 %	0 %	50 %	50 %	410859669
303	NC_019393	TG	3	6	19195	19200	0 %	50 %	50 %	0 %	410859669
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